Темрюкский историко-археологический музей – один из старейших музеев на территории Краснодарского края. Он был создан в 1920 году. Инициаторами его создания были учителя города во главе с краеведом и исследователем Таманского полуострова Сергеем Францевичем Войцеховским.
В 1960-е годы в музее был открыт зал природы и истории кубанского казачества, а в начале 80-х годов была проведена реэкспозиция всех залов музея. В 1979 году Темрюкский историко-археологический музей вошел на правах филиала в Краснодарский государственный историко-археологический музей-заповедник им. Фелицына, а в 1983 году Темрюкскому музею было передано одно из старейших зданий в городе – бывшая аптека, построенная в конце XIX века. В этом здании музей располагается и по настоящее время, сохраняя его как памятник архитектуры.
В течение года экспонируются выставки из фондов музея. Экспозиции посвящены темам истории Боспорского царства, Великой Отечественной войны, природы Тамани, порта Темрюк.