Церковь Богоявления возведена в 1684–1693 годах на средства богатого купца Алексея Зубчанинова. Ныне находится в совместном использовании Ярославского музея-заповедника и Русской православной церкви. Храм до сих пор играет важную роль в архитектурном ансамбле набережной реки Которосли, вместе с монастырским ансамблем как бы защищая въезд в город со стороны Москвы.
Главным украшение храма стали многоцветные поливные изразцы, которые сегодня считаются визитной карточкой города. Сохранились фрески и иконостас конца XVII века. Роспись состоит из 320 сюжетных клейм и сохранилась практически полностью.
Памятник архитектуры доступен для посещения в теплое время года, с 1 октября закрыт для сохранения фресковых росписей.