Национальный музей Республики Бурятия создан в 2011 году путем слияния трех музеев: Музея истории им. М. Н. Хангалова, Художественного музея им. Ц. С. Сампилова и Музея природы Бурятии. В 2012 году к музею присоединился Новоселенгинский музей декабристов. Основной фонд ГАУК РБ «Национальный музей Республики Бурятия» насчитывает 75193 тыс. единиц хранения.
Музей истории Бурятии создан 10 октября 1923 года. В 1958 году музею было присвоено имя выдающегося бурятского этнографа Матвея Хангалова (1858–1918). В фондах хранятся уникальные памятники культуры народов Бурятии, Центрально-азиатского региона, историко-этнографические материалы сибирских родов и племен.
Художественный музей им. Ц. С. Сампилова создан в 1943 году. Основой фондов музея послужили произведения бурятских художников.
Музей природы Бурятии открыт 12 июля 1983 года на основе отдела краеведческого музея им. М. Н. Хангалова. Расположен музей в здании – памятнике федерального значения «Дом общественного собрания». Современный объем фондов музея включает палеонтологические, зоологические, геологические, ботанические коллекции, отражающие биоразнообразие природы Бурятии.
Новоселенгинский музей декабристов является первым музеем, посвященным декабристам Забайкалья. Он был открыт к 150-летию восстания декабристов на Сенатской площади 24 декабря 1975 года. Музей расположен в доме купца первой гильдии, почетного гражданина города Селенгинска Д. Д. Старцева.