Холмогорский краеведческий музей основан в 2002 году. Располагается в доме, построенном в 1908 году Д. Ф. Берденниковым – владельцем маслодельных, лесопильных и кожевенных заводов, а также десятка торговых лавок по всему Холмогорскому уезду. Началом коллекции послужили экспонаты, собранные для школьного музея учащимися Холмогорской школы.
В настоящее время семь залов Холмогорского краеведческого музея рассказывают об истории и природе Холмогор, резьбе по кости, холмогорской породе скота, семье Берденниковых, реалиях и быте советского времени. Отдельные залы посвящены Великой Отечественной войне и родившемуся в Холмогорах фронтовику, общественному деятелю, публицисту и писателю Н. К. Жернакову.
