История Национального музея имени А. В. Анохина началась в октябре 1918 года, когда председатель Каракорум-Алтайской окружной управы, художник Г. И. Чорос-Гуркин приобрел у известного сибирского краеведа Н. С. Гуляева палеонтологическую, археологическую и минералогическую коллекции, научную библиотеку и архив. Эти материалы и составили основу будущего музея.
Сегодня в музее хранится мумия женщины пазырыкской культуры V–III веков до н. э., получившая в народе имя «укокской принцессы». Во внутреннем дворе музея размещен бревенчатый сруб гробницы скифского вождя V–III веков до н. э. Это самая древняя и большая деревянная в мире погребальная камера. Шаманизму как особой форме видения мира посвящен отдельный зал.