Датой основания биологического музея считается 1966 год. В 2015 году музей переименован в зоологический.Он был создан на базе небольшого собрания экспонатов (чучел зверей и птиц, влажных препаратов рыб, амфибий и рептилий) кафедры зоологии ДГУ, собранных под руководством Зои Павловны Хонякиной. Кафедра зоологии передала в музей первые 87 экспонатов. Чучела делались руками студентов.
Заведовать музеем назначили Тамилу Хасбулатовну Спасскую, проработавшую на своей должности почти 35 лет.
В 1969 году музей был открыт для посещения учащихся школ, техникумов и вузов.
В настоящее время зоологический музей ДГУ принимает посетителей всех возрастов – студентов, школьников, туристов. Проводятся мероприятия: временные выставки, посвященные различным памятным датам, праздникам и событиям, связанным с тематикой музея; конференции; тематические сценарии; показ фильмов; экологические праздники; лекции; мастер-классы.
На сегодняшний день музейная экспозиция насчитывает около 800 экспонатов, не считая насекомых, которых около 3 тысяч экз. Помещение музея состоит из 2 залов. Ежегодно музей посещают от 1 500 до 2 000 человек.
