Здание музея было построено в XVIII в. как сыроварня в имении барона И. Ю. Фредерикса, в XIX в. здесь располагалась хозяйственная и жилая постройка в имении дворянского рода Всеволожских, в 1930–1941 гг. – дом отдыха работников ленинградской пищевой промышленности, в эти годы возникло его неофициальное название – «Дом пекарей». В 1941–1942 гг. – дом отдыха летчиков, куда после выполнения сложных боевых заданий прибывали летчики 1-го минно-торпедного авиационного полка Краснознаменного Балтийского флота, 26-го и 27-го истребительно-авиационных полков и других авиационных частей, сражавшихся в небе Ленинграда и защищавших Дорогу жизни.
В «Дом авиаторов» к летчикам приезжали деятели культуры, среди них К. И. Шульженко, Н. К. Черкасов и многие другие. В послевоенный период в доме поочередно располагались дом отдыха работников ленинградской пищевой промышленности, спортивная лыжная база «Снежок», пионерский лагерь «Березка».
2015 г. – воссоздание объекта культурного наследия «Дом авиаторов», входящего в состав ГБУК ЛО «ММК «Дорога жизни» как «Дом, где в 1941–1944 гг. жили авиаторы, защищавшие Ленинград; среди них – многие Герои Советского Союза: Бунимович Ю. З., Колесник П. А., Преображенский Е. Н., Чванов В. Г. и другие».
Экспозиция музея включает в себя макеты самолетов, полноразмерные макеты авиабомб, скульптуры летчиков в полной аутентичной летной экипировке, интерактивные карты боевых действий, элементы военного быта авиаторов, мультимедийные квесты.
