Здание краеведческого музея было построено в 1970 году. 9 июня 1972 года в новом здании музея была открыта первая экспозиция по краеведению. Целенаправленное комплектование музейных коллекций началось в 1950-е годы. Пополнение коллекций особенно активно шло в 1960–1980-е годы. Фонды Ялуторовского музейного комплекса насчитывают более 35 тыс. единиц хранения.
В современное время в здании краеведческого музея разместилась выставка «Ялуторовск: грани истории», рассказывающая об истории города и края с момента основания острога до наших дней. Также представлен новый выставочный проект «Закрытые коллекции. Вход разрешен», где в открытом хранении представлены коллекции живописи, скульптуры, керамики, стекла, металла и дерева.
