В пространстве музейной экспозиции уместились разделы в хронологическом диапазоне от палеозоя (около 500 млн лет назад) до наших дней. Гости музея имеют возможность познакомиться с интересными палеонтологическими находками, с предметами, полученными в ходе археологических и этнографических экспедиций и подаренными музею частными лицами. Они смогут увидеть костные останки ископаемых животных, интересные археологические артефакты и находки, характеризующие культуру народов Алтайского края. В отдельном разделе представлены христианские святыни (иконы, кресты, книги Священного Писания и прочее), поступившие в музей в дар от жителей разных районов края.
Посетителям предлагаются обзорные ознакомительные экскурсии, ориентированные на широкую аудиторию, от младших школьников до специалистов. По предварительной договоренности проводятся тематические экскурсии этнографического и археологического профиля, в том числе: «Древнейшее прошлое Алтая (от каменного века до средневековья)», «Традиции русского крестьянского дома», «Христианские святыни (иконы, кресты, книги) в жизни сельского населения Алтая», «Божественная книга» в музейном пространстве, «Немцы Алтая: история и семейные традиции», «История горно-металлургического производства на Алтае», «Источники и методы полевых археологических и этнографических исследований» и др.
