Верхнетоемский музей был открыт 9 мая 1985 года в селе Верхняя Тойма. Музей создавался на основе комнаты боевой и трудовой славы, организаторами которой были ветераны войны и труда райцентра. С 1985 по 1991 г. г. на общественных началах музеем руководили Аристова Мария Петровна и Некрасова Зинаида Петровна. С 1991 по 1994 г.г. музей функционировал как музейный отдел районного дома культуры. В 1994 году было принято решение о создании муниципального музея с центром в Верхней Тойме (Верхнетоемский районный краеведческий музей) и филиалами в селе Вознесенское и деревне Кондратовской. С передачей районному музею в 2010 году здания, расположенного на ул. Кулижского, основные экспозиции также переместились в это здание.
В 2018 году музею дополнительно были переданы еще два больничных здания. Таким образом, появилась возможность объединить территорию в музейных комплекс. Значительную часть фонда составляет этнографическая коллекция: коллекция бранного ткачества (полотенца, детали одежды), золотного шитья местных рукодельниц конца XIX — нач. XX в. Интересен фотофонд музея: собираются как фотографии XIX века, так и XX века различной тематики. Фотофиксацией событий, мест и прочего музей занимается с 2008 года.
