Храм Иоанна Предтечи (1671–1687 гг.) задумывался и строился как нечто особенное, «чего прежде никогда не было», поэтому с момента закладки сопровождался большим количеством вкладов и пожертвований, поражая богатством внутреннего убранства и количеством драгоценной утвари.
Самый большой храм Ярославля XVII века, до сих пор остается одной из самых заметных построек в городе. Храм имеет два придела, которые завершаются тесно сдвинутыми пятиглавиями. Их высота равна высоте центрального храма, из-за чего с востока церковь выглядит как огромный 15-главый храм с 5-апсидным алтарем.
Внешний вид храма поражает разнообразием декоративных форм. Здесь применены все основные приемы декора русской архитектуры XVII века, среди которых главное место занимает фигурный кирпич. Разнообразие его форм огромно – от скромных профилей до целых фигурных плит: это разнообразные бусины, розетки, валики, косички, колонки разных размеров и форм, дыньки, кокошники и т. д. Эта изощренная каменная краснокирпичная «резьба» прекрасно сочетается с цветными изразцами.
Монументальная живопись этого памятника относится к лучшим образцам русского искусства XVII века. Храм расписывала ярославская артель из 16 художников с 5 июня 1694 г. по 6 июля 1995 г. Руководили артелью известные ярославские знаменщики Дмитрий Григорьев Плеханов и Федор Игнатьев. Росписи храма Иоанна Предтечи в Толчкове не имеют себе равных в мировом искусстве по количеству изображаемых сюжетов (более полутора тысяч).
Изображение церкви помещено на оборотной стороне 1000-рублевой купюры, выпущенной в обращение в 2001 году.
В настоящее время храм находится в составе Ярославского музея-заповедника и используется как объект музейного показа.
