Музей открыл свои двери всем желающим 27 октября 1987 года как музей на общественных началах. В 1990 году он стал филиалом Ветлужского государственного краеведческого музея, а 1 января 1992 года Тоншаевский государственный краеведческий музей приобрел статус самостоятельного учреждения культуры. В 2005 году приобрел статус юридического лица и стал муниципальным учреждением культуры Тоншаевского района.
Музей сегодня – это образовательный центр, на базе которого вместе с районным отделом образования проводятся занятия по музейной педагогике для воспитателей детских садов района. Успешно реализуется образовательная программа «Музей и дети» для воспитанников детских садов.
Активно развивается выставочная деятельность. Ежегодно музей предлагает населению разнообразные выставки декоративно-прикладного и изобразительного творчества, фотографий, личных коллекций, выставки-продажи, которые традиционно вызывают интерес большого числа посетителей.
Для изучения истории, возрождения, сохранения традиционных промыслов и ремесел края 11 лет на базе музея работает «Школа народных ремесел». Организуются творческие встречи с мастерами, персональные выставки, мастер-классы по старинным народным промыслам: вышивке, резьбе по дереву, плетению лаптей и корзин, ткачеству, изготовлению народной игрушки.