Дом-музей Ем. Ярославского был построен в 1912 г. во дворе тогда нового здания библиотеки и музея для проживания работников Якутского областного музея и публичной библиотеки. С 1915 по 1917 гг. во время Якутской ссылки в этом доме жил консерватор Якутского областного музея, видный революционер Емельян Ярославский (Миней Израилевич Губельман). Живя в этом доме, Ярославский сделал многое для улучшения и обновления экспозиции музея, организовал экспедицию по сбору экспонатов, написал ряд научных заметок по вопросам краеведения. В стенах дома происходили занятия нелегальных революционных кружков, организованных Ем. Ярославским. Кружки посещали местные учащиеся, которые впоследствии стали крупными политическими деятелями Якутии: Максим Аммосов, Платон Слепцов-Ойунский, Степан Васильев, Степан Аржаков, Исидор Иванов-Барахов и др.
30 августа 1960 г. Постановлением Совета Министров РСФСР от 30 августа 1960 г. дом стал объектом культурного наследия федерального значения.
В 1960 г. здание было перенесено на территорию Якутского республиканского краеведческого музея им. Ем. Ярославского, в 1968 г. к 90-летию со дня рождения Ем. Ярославского была поставлена первая экспозиция.
24 апреля 2015 г. после реставрации Дом-музей Ем. Ярославского вновь открыл свои двери для посетителей. Новая экспозиция музея рассказывает об истории создания и становления Якутского музея с 1891 по 1980-гг. Кульминационная часть экспозиции посвящена жизни и деятельности Ем. Ярославского.
