Музей ведет свою историю с 18 июля 1909 года, когда дачевладельцы Солнцедара (Тонкий Мыс) торжественно открыли Естественно-исторический музей, разместившийся в сторожке действительного статского советника Михаила Михайловича Рейнке. История основания и становления Геленджикского историко-краеведческого музея непроста, она неразрывно связана с историей страны. Политические и экономические преобразования, революции и войны, смена государственной власти, несомненно, сказались на развитии музея. За свою более вековую историю музей несколько раз закрывался и снова «рождался». И каждый раз музейная коллекция восстанавливалась и пополнялась!
Сегодня музей имеет более 100 тысяч единиц хранения основного и научно-вспомогательного фонда, научного архива. Он располагает археологическими, естественно-научными, историческими, этнографическими коллекциями, коллекцией оружия и редкой книги. В настоящее время в структуре музея – 9 научных отделов: отдел истории, отдел фондов, отдел научно-просветительской работы, отдел маркетинга и научно-методической работы, отдел природы, отделы «Батарея № 394 капитана А. Э. Зубкова», «Дом-музей В. Г. Короленко», «Городской выставочный зал», художественно-издательский отдел.
Геленджикский историко-краеведческий музей – участник туристического маршрута «Золотое кольцо Боспорского царства», где в античное время располагались города древнего государства.
