Научный музей Института вулканологии СО АН СССР был создан в 1963 г . Первым заведующим музеем была Т. Ю. Маренина, с 1965 – С. Ф. Главатских, с 1967 г . – Е.К. Мархинин, с 1971 г . – М. М. Василевский. С 1975 г . по 2004 г . Научный музей входил в состав лабораторий Активного вулканизма и Оптического и микрозондового анализа. Научный музей вулканологии как структурное подразделение Института вулканологии и сейсмологии Дальневосточного отделения Российской Академии Наук (ИВиС ДВО РАН) вновь был создан 1 января 2005 г . Таким образом, коллекции образцов музея и его фонды со времени его создания собирались тремя поколениями вулканологов. Научный музей вулканологии – единственный в России специализированный музей, располагающий систематической коллекцией большинства известных современных вулканических и поствулканических типов пород и минералов.
Музей имеет региональные и тематические коллекции, представляющие продукты современной вулканической и поствулканической деятельности большинства вулканов Камчатки, Курильских островов и ряда вулканов Тихоокеанского, Атлантического и Средиземноморского регионов.
В соответствии со статусом Научного музея вулканологии его работа тесно связана с научной и научно-организационной деятельностью ИВиС ДВО РАН.
