Предметом охраны объекта культурного наследия «Мастахская Покровская церковь» являются:
- Местоположение и объемно-пространственная характеристика одноэтажного здания, участвующего в формировании всего комплекса построек поселка Балагачча;
- Габариты и характер старинной столярной обработки стен бревенчатого сруба с углами, сложенными «в лапу», стены;
- Конфигурация и столярное оформление исторических (оригинальных) дверных и оконных проемов здания, столярное оформление дверных полотнищ с колодами, полы и потолки из толстых досок, двускатная крыша;
- Архитектурно-художественное оформление фасадов церкви, сложившиеся в XIX – нач. ХХ вв. в Якутии;
- Характер обработки фасадных поверхностей наружных стен здания, вход с односкатным навесом, крыльцо со ступеньками, отесанная внутренняя сторона венцов здания, стесанные в виде брусков балки верхних перекрытий;
- Внутренний интерьер комнат с входными проемами и дверными полотнищами, прямоугольные короба оконных проемов;
- Металлические кованые изделия: гвозди разных размеров, петли, шарниры, полосы, крючья ручки ручной кузнечной работы.