Предметом охраны объекта культурного наследия федерального значения «Дом, в котором жил политссыльный и составитель первого русско-якутского словаря Пекарский Эдуард Павлович. В доме - музей Э.П. Пекарского» являются:
- местоположение и габариты памятника, формирующего композицию этнографической зоны музея;
- композиция и архитектурное строение срубно-балаганной конструкции юрты, включая объемные параметры срубного дом, стоечно-балочную конструкцию юрты её параметры и плоскую бревенчато-грунтовая крышу;
- характер столярной обработки внешних и внутренних стен постройки, предметов внутреннего убранства, окон и дверей юрты;
- историческая планировка интерьера юрты сложившаяся в конце XIX в.
Не являются предметом охраны объекта культурного наследия музейные экспонаты, размещенные на в объекте культурного наследия.
