Предметом охраны объекта культурного наследия «Хаяхсытская Николаевская церковь с колокольней (деревянная)» являются:
- Местоположение и объемно-пространственная характеристика двухэтажного здания, покоящегося на стульях, заглубленных в землю, по оси запад – восток трехъярусной со звонницей колокольни, трапезной, собственно трехэтажного храма и двухэтажной алтарной части, участвующих в формировании всего комплекса построек поселка Арылах;
- Габариты и характер старинной столярной обработки стен бревенчатого сруба с углами, сложенными с углами «в лапу», стены, купольный характер кровли колокольни, храма и апсиды, двускатная крыша трапезной, высотные отметки колокольни, храма, апсиды с крестами, главки трапезной, храма, алтаря, скаты с карнизом без декора по периметру;
- Конфигурация и столярное оформление исторических (оригинальных) дверных и оконных проемов дома, столярное оформление дверных полотнищ с колодами, пороги и наличники из досок, полы и потолки из толстых досок, прямоугольные окна с ажурными металлическими решетками;
- Архитектурно-художественное оформление фасадов церкви, трехъярусной классического стиля колокольни, храма и прямоугольной апсиды, сложившиеся в XIX вв. в Якутии;
- Характер обработки фасадных поверхностей наружных стен здания, вход с двускатным навесом, крыльцо со ступеньками, отесанная внутренняя сторона венцов здания, стесанные в виде брусков балки верхних перекрытий, карнизные скаты по периметру здания из профилированных досок без декора;
- Внутренний интерьер комнат (ризницы) с входными проемами и дверными полотнищами, оригинальные наличники с ажурным декором и прямоугольные короба оконных проемов, лестницы, ведущие на верхние ярусы колокольни;
- Металлические кованые изделия: гвозди разных размеров, петли, шарниры, полосы, крючья ручки ручной кузнечной работы, дюралюминиевая доска с надписью.
Хаятсытская Николаевская церковь подлежит сохранению как сельский православный храм Якутии, построенный в конце X1X в. Представляет яркий пример северного культового зодчества.
Не являются предметом охраны объекта культурного наследия музейные экспонаты, расположенные в церкви.
